MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015850	CGT	2	6	1525573	1525578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_015850	CCCT	2	8	1525628	1525635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3503	NC_015850	GCGG	2	8	1525642	1525649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_015850	GC	3	6	1527404	1527409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_015850	GGT	2	6	1527452	1527457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015850	T	6	6	1527457	1527462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015850	GCT	2	6	1527572	1527577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_015850	GC	3	6	1527607	1527612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_015850	CG	3	6	1527640	1527645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_015850	CG	3	6	1530388	1530393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_015850	A	6	6	1530445	1530450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015850	GTC	2	6	1530469	1530474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_015850	TGC	2	6	1530480	1530485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_015850	GCC	2	6	1530497	1530502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_015850	CGA	2	6	1530510	1530515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_015850	TCT	2	6	1530525	1530530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015850	TTG	2	6	1530566	1530571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015850	TCTGGT	2	12	1530586	1530597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3519	NC_015850	CGG	2	6	1530631	1530636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_015850	GGT	2	6	1530655	1530660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_015850	GACC	2	8	1530956	1530963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_015850	GGC	2	6	1530966	1530971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_015850	ATGG	2	8	1537110	1537117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015850	GAT	2	6	1539468	1539473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015850	GCC	2	6	1539521	1539526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_015850	GCG	2	6	1539530	1539535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015850	CCG	2	6	1539588	1539593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015850	CG	3	6	1539671	1539676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_015850	ATCG	2	8	1539698	1539705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_015850	A	6	6	1542329	1542334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_015850	GCA	2	6	1542378	1542383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_015850	AAGG	2	8	1543157	1543164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015850	TGG	2	6	1543183	1543188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015850	CGG	2	6	1543283	1543288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015850	GGA	2	6	1543316	1543321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_015850	GATGG	2	10	1551675	1551684	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015850	GGC	2	6	1551696	1551701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3539	NC_015850	GGC	2	6	1551791	1551796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015850	TCT	2	6	1553318	1553323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_015850	GCA	2	6	1557428	1557433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015850	AT	3	6	1558981	1558986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015850	GAC	3	9	1560544	1560552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_015850	TC	3	6	1560992	1560997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_015850	CG	3	6	1561043	1561048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_015850	TCG	2	6	1561158	1561163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015850	AGC	2	6	1561177	1561182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_015850	GTA	2	6	1561185	1561190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015850	TCG	2	6	1561191	1561196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_015850	AGAT	2	8	1562910	1562917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015850	TAT	2	6	1563055	1563060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_015850	CTG	2	6	1563075	1563080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015850	ATGG	2	8	1563095	1563102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015850	AGC	2	6	1563111	1563116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015850	AC	3	6	1564465	1564470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_015850	CCTC	2	8	1564471	1564478	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3557	NC_015850	TAC	2	6	1564495	1564500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015850	CG	3	6	1567853	1567858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_015850	CAG	2	6	1567864	1567869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_015850	CAT	2	6	1567920	1567925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015850	AT	5	10	1567943	1567952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015850	GAT	2	6	1567960	1567965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015850	AT	3	6	1567964	1567969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015850	GCT	2	6	1567997	1568002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015850	GGT	2	6	1568096	1568101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015850	CAG	2	6	1568178	1568183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_015850	A	6	6	1568209	1568214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015850	CGCT	2	8	1568229	1568236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_015850	GAA	2	6	1569930	1569935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015850	GAT	2	6	1569955	1569960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015850	CAC	2	6	1570054	1570059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_015850	T	6	6	1570092	1570097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015850	ATCC	2	8	1570217	1570224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_015850	GGCT	2	8	1570312	1570319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_015850	GAT	3	9	1572338	1572346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015850	TAGGC	2	10	1572350	1572359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3578	NC_015850	CTTAA	2	10	1575090	1575099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3579	NC_015850	TC	3	6	1580885	1580890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_015850	AGG	2	6	1581063	1581068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_015850	GC	3	6	1587180	1587185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_015850	AGC	2	6	1588644	1588649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_015850	GGT	2	6	1589563	1589568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015850	GAG	2	6	1589686	1589691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_015850	C	8	8	1589933	1589940	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3587	NC_015850	T	6	6	1589984	1589989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_015850	CGA	2	6	1590009	1590014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015850	TTC	2	6	1590030	1590035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015850	CGT	2	6	1590043	1590048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_015850	GTT	2	6	1590074	1590079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_015850	GAG	2	6	1590203	1590208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015850	TGA	2	6	1590213	1590218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015850	CCG	2	6	1590230	1590235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_015850	TGC	3	9	1590317	1590325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015850	CGC	2	6	1590397	1590402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_015850	TGG	2	6	1590412	1590417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015850	CAG	2	6	1590424	1590429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_015850	CTT	2	6	1590475	1590480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_015850	TCT	3	9	1590522	1590530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_015850	ATG	2	6	1590679	1590684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015850	GGT	2	6	1590687	1590692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015850	CTC	2	6	1590703	1590708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_015850	AG	3	6	1591423	1591428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015850	TAC	2	6	1591505	1591510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015850	CTA	2	6	1591529	1591534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_015850	GAT	2	6	1591552	1591557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_015850	CCT	2	6	1592701	1592706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_015850	AGGGC	2	10	1592756	1592765	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3610	NC_015850	AAG	2	6	1592803	1592808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015850	GC	3	6	1592890	1592895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_015850	GAG	2	6	1594927	1594932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_015850	CATCGA	2	12	1594965	1594976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_015850	T	6	6	1596301	1596306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015850	CAA	2	6	1596466	1596471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_015850	GAC	2	6	1598797	1598802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_015850	TC	3	6	1598869	1598874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_015850	CCAT	2	8	1602292	1602299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_015850	ACATT	2	10	1602997	1603006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3620	NC_015850	CG	3	6	1603048	1603053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_015850	T	6	6	1603095	1603100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015850	A	7	7	1603889	1603895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015850	T	7	7	1603906	1603912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_015850	GTC	2	6	1603916	1603921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_015850	A	6	6	1606564	1606569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015850	TC	3	6	1607366	1607371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_015850	T	6	6	1607378	1607383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_015850	CGG	2	6	1607397	1607402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_015850	GTG	2	6	1607443	1607448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_015850	CGC	2	6	1607503	1607508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_015850	GCC	2	6	1610122	1610127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_015850	TGG	2	6	1610132	1610137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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